I begyndelsen af Treårskrigen 1848-50 blev tropperne fra Sjælland ført til krigsskuepladsen over Korsør. De blev indskibet i færgesmakker eller andre sejlskibe, som så blev bugseret flere ad gangen af dampskibe. Blandt disse transporter har Otto Baches maleri fra 1888 særlig gjort udskibningen af Hestgarden kendt. Den store transportopgave, hvor der blev anvendt ni dampskibe, blev organiseret af søværnet med hjælp fra lokale skibsfartskyndige, bl.a. skibsreder Jørgen Kruuse.
Som det øvrige land blev Korsør grebet af ånden fra 48. Niels Sylow, der var med i krigen som frivillig, fortæller, hvorledes borgere og embedsmænd kappedes om at få soldater i indkvartering. Der blev samlet linned ind til hæren, strikket strømper, pillet charpi til forbindinger, og bagt brød. Der synes imidlertid ikke at have været kapacitet til at modtage gaverne. Den skarpe Eline Boisen i Skørpinge beretter, hvorledes de gode sager længe sås slænget omkring hos købmændene i Korsør. Brødet endte som svinefoder, og charpiet lå i bunker i gulvsandet. Lokalt kom Treårskrigen til at koste to faldne i 1849. 
Blandt krigsdeltagerne bemærkes særlig tømrer Ole Nielsen, Halseby. Han var med alle tre krigsår, og i træfningen ved Mysunde september 1850 var han underofficer ved et halvbatteri, der hørte under batteriet Dinesen, Karen Blixens farfar. Halvbatteriets chef faldt ved kampens begyndelse, hvorefter Ole Nielsen overtog kommandoen og fortsatte skydningen med kraft. Han blev dannebrogsmand for sin indsats, og da han døde i 1869, samlede sognets beboere ind til et gravmonument for ham.