Den intensiverede trafik på Bæltet stillede større krav til sikkerheden. Fra omkring 1860 til 1931 var der lodstvang i havnen for skibe over 20 tons. De eksisterende fyrpositioner bevaredes. Kulfyret på Lygtebakken stod i beredskab som reservefyr til 1904. Et nyt lampefyr erstattede i 1893 det hidtidige lampefyr på Lygtebakken. Samme år blev de to hvide ledefyr ved indsejlingen erstattet af to fyr i gitterjernsmaster. De hvide fyr blev revet ned 1904. Blinkfyret på Sprogø blev i 1868 erstattet med et fyrtårn med blinkfyr.
I 1880 blev postvæsenets fyr- og signalskib på Korsør Red inddraget, og i 1883 blev et fyrskib udlagt samme sted. Det blev i 1912 afløst af Statsbanernes fyrbåke Koen med blinkfyr og tågesignal. På enderne af de to bølgebrydere, der blev bygget ud for havnen i 1903, var opstillet blinkfyr. I 1921 blev Halsskov Rev Fyrskib udlagt. Når det forlod sin station, fungerede fyret på Lygtebakken som reserve for det. Til brug for færgerne fra Halsskov Færgehavn blev fyrbåken Tyren sat ud.
Siden 1885 blev anvendt lystønder med blinkende lys i de danske farvande. Gassen til disse tønder blev fra 1887 produceret på fyrvæsenets gasstation i Korsør. Fra 1953 havde et af fyrvæsenets inspektionsskibe hjemsted i Korsør. Svitzers Bjergningsentreprise havde fra 1881 et af sine skibe stationeret i Korsør.